El Hermano Daniel, quien fue director del Museo del Colegio San José de La Salle (1933-1971), fue un gran botánico que llegó a recolectar, clasificar y montar más de 10.000 muestras de plantas de varios lugares del país.

Actualmente el Museo cuenta con 644 especímenes botánicos, los cuales componen una pequeña muestra de la biodiversidad vegetal de nuestro país; algunas semillas, plantas debidamente montadas y otros elementos hacen parte de este patrimonio natural.